Nos dias 06 e 07 de junho de 2009, realizou-se a IV Assembleia de Pastoral, com o lema: “Discípulos Missionários a Caminho”; foi assessorada pelo Pe. Nelito Dornelas, de Governador Valadares. No final desta assembleia, como diagnóstico da realidade diocesana, verificou-se a seguinte situação geral:
* Faltam pessoas comprometidas para assumir os trabalhos na Igreja;
* Desinteresse geral pela Igreja, desvalorizando o sagrado;
* Busca por outras Igrejas;
* Contentamento e até encantamento pelas coisas religiosas na TV;
* Êxodo rural;
* Falta de preparo de quem assume algo na Igreja, e as críticas que recebem;
* Distância física entre as comunidades paroquiais;
* Muita indiferença religiosa, fragmentando valores familiares e vice-versa;
* Ter um padre por paróquia (sonho ou ideal).
A exemplo das outras, o empenho de Dom Emanuel foi enorme na organização da IV Assembleia de Pastoral, à luz do Documento de Aparecida e das Diretrizes Gerais da Ação Evangelizadora da Igreja no Brasil. Destacou-se a urgência de conversão pessoal, pastoral e missionária. Voltou-se o olhar para a realidade sociocultural, econômica, política e religiosa, destacando a Igreja em estado permanente de missão.